Pryszczarek kapustnik jest groźnym szkodnikiem łuszczyn rzepaku, do których samice składają jaja przez otwory wykonane wcześniej przez chowacza podobnika lub mechaniczne uszkodzenia. Wylęgające się larwy wysysają soki z wnętrza łuszczyn, co powoduje ich przedwczesne żółknięcie, deformację oraz pękanie, prowadząc do osypywania się nasion przed zbiorem. Szkodnik ten rozwija kilka pokoleń w roku, a masowy wylot muchówek następuje w okresie kwitnienia i zawiązywania łuszczyn. Jest to kluczowe zagrożenie ekonomiczne, gdyż straty w plonie nasion mogą być bardzo wysokie, zwłaszcza przy dużej presji szkodnika współwystępującego.